長照機構設立及稅務－營所稅與營業稅申報

隨著臺灣正式邁入超高齡社會，長期照顧產業已成為近年最具成長潛力的產業之一。無論是居家式服務、社區式機構，或住宿型長照機構，從「設立登記」到「稅務申報」，每一個環節都涉及複雜的法規與稅務規範。若規劃不當，輕則補稅受罰，重則影響經營資格與補助申請。

本所特別彙整長照機構設立流程與營所稅、營業稅申報重點，協助您一次掌握關鍵風險與合規重點。

一、長照機構設立類型與法律架構

長照機構依設立主體不同，將直接影響稅負、補助資格、盈餘分配、負責人責任風險，實務上可分為四大類：

✅長照機構設立型態比較表

設立型態	設立主體	是否可分配盈餘	是否課營所稅	補助申請彈性	適合對象
財團法人設立之長照機構	捐款人	❌ 不得分配	原則免稅	✅ 高	公益型長照
社團法人附設長照單位	會員	❌ 不得分配	原則免稅	✅ 高	協會型單位
公司型長照機構（有限公司、股份有限公司）	股東	✅ 可分配	✅ 課稅	中	投資營利型
個人獨資或合夥經營	個人	✅ 歸個人	✅ 綜所稅	低	小型居服

不同的設立型態，將直接影響：

是否具備免稅資格
適用何種營所稅率
補助款是否列為應稅收入
盈餘分配與負責人稅負規劃

⚠️ 實務上最常發生的風險，就是「以長照名義設立，卻被認定為營利事業課稅」。

二、營業稅申報重點（長照是否免稅？）

依現行稅法規定：

✅ 依法立案之長照機構提供之照護勞務，多屬於營業稅免稅項目
❌ 但若另有販售：
- 保健食品
- 輔具設備
- 陪診交通服務
- 住宿以外之附加商業服務

👉 則該「附加銷售行為」仍須課徵 5% 營業稅

常見錯誤風險

錯誤將「全部收入」列為免稅
收據開立錯誤（免稅與應稅未區分）
補助款誤列為免稅營業收入

✅ 正確作法必須區分：

免稅收入
應稅收入
補助收入
代收代付項目

三、營所稅申報重點（是否真的免營所稅？）

是否免營所稅，關鍵不在是否為長照，而在「法律型態」：

✅長照營所稅課稅對照表

型態	是否課營所稅	申報重點
財團法人	原則免稅	需符合公益性
社團法人	原則免稅	盈餘不得分配
公司型	✅ 課稅	20% 稅率
個人	✅ 綜所稅	併入個人申報

公司型長照常見稅務錯誤

將負責人私帳支出列為公司費用
員工薪資未依法扣繳申報
補助款未納入收入
盈餘分配漏申報股利所得

➡️ 一旦被查核，常面臨：

補稅
罰鍰
負責人個人補稅風險

四、補助款、捐款與政府補貼的稅務處理

長照機構常涉及：

✅ 中央或地方政府補助款
✅ 公益捐贈收入
✅ 企業贊助

這三類收入在：

營業稅
營所稅
會計帳務列帳方式

皆有完全不同處理方式，若處理錯誤，容易構成：

漏報收入
錯誤免稅申報
資金流向不明的洗錢防制風險

五、為什麼長照產業更需要專業會計師？

長照產業結合了：

✅ 社福法規
✅ 商業會計
✅ 稅務申報
✅ 政府補助制度
✅ 勞資法規
✅ 洗錢防制與內控制度

若僅由一般業者處理，極容易忽略：

「免稅與應稅」混用
「補助帳務」錯誤入帳
「負責人帳戶」與「機構帳戶」混用
「費用攤提」未符查核準則

六、本所可提供的長照專業服務

本所提供長照機構一站式專業服務：

✅ 長照機構設立規劃（法人 / 公司 / 個人）
✅ 營業稅免稅與應稅項目正確判斷
✅ 營所稅申報與節稅規劃
✅ 補助款帳務與查核因應
✅ 負責人稅務風險隔離
✅ 洗錢防制與內控制度建置
✅ 勞資扣繳與二代健保申報

結語：設立長照不是最難，真正的風險在「後端稅務」

許多經營者在成立初期順利取得長照資格，卻在營業稅、營所稅、補助款查核階段頻頻出問題，最終導致：

補稅上百萬
補助遭追回
負責人個人遭連帶課稅

長照是公益產業，但稅務絕對不能用「公益心態」處理，而必須用「專業制度」管理。

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